一种基于BERT模型的密码子优化方法及系统

本发明公开了一种基于BERT模型的密码子优化方法及系统，所属领域为生物信息学与基因工程的交叉技术领域，该方法包括：在特定物种的基因组上训练BERT模型；利用模型中的多头自注意力机制，提取基因组序列的上下文语义特征；通过模型输出解析密码子之间的上下文依赖关系，实现针对宿主特异性的密码子优化。本发明能够显著提高目标蛋白的表达水平，本发明提供的密码子优化方法可广泛应用于工业酶、蛋白药物等的异源表达，突破了传统方法无法识别宿主特异性密码子上下文依赖关系的技术瓶颈。