一种选择性状态空间建模的高效蛋白质稳定性预测方法

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一种选择性状态空间建模的高效蛋白质稳定性预测方法
申请号:CN202510983209
申请日期:2025-07-17
公开号:CN120496640B
公开日期:2025-10-21
类型:发明专利
摘要
本发明涉及蛋白质预测技术领域,公开了一种选择性状态空间建模的高效蛋白质稳定性预测方法。本发明采用了BiMamba和CoGNN两个核心模块,通过选择性状态空间建模和协同图神经网络相结合的方式,突破了现有方法在计算效率和多尺度信息处理上的限制。本发明提出了基于k跳子图的局部采样策略,通过聚焦突变位点周围的关键环境实现高效计算;采用双向选择性状态空间模型以线性复杂度建模长程依赖关系,有效克服传统Transformer架构的计算瓶颈。本发明开发的门控融合模块能够自适应整合长短程特征,使模型能够针对不同类型的突变灵活调整特征组合策略,提升了蛋白质ΔΔG预测的准确性和效率。
技术关键词
状态空间模型 稳定性预测方法 多层感知机 结构特征提取 多尺度特征融合 节点特征 突变型 序列特征 局部结构特征 生成动作 矩阵 加权特征 野生型蛋白质 代表 位点 氨基酸骨架 消息传递机制 通道注意力机制 输出特征
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