一种基于简易基因组组装的无参考基因组物种个体识别方法

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一种基于简易基因组组装的无参考基因组物种个体识别方法
申请号:CN202511030508
申请日期:2025-07-24
公开号:CN120932735A
公开日期:2025-11-11
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种简易基因组组装的无参考基因组物种个体识别方法,属于生物信息学和遗传学技术领域。针对缺乏参考基因组的物种,本发明提供了一种完整的个体识别流程,包括简易基因组的组装、群体SNP位点库的构建以及低深度测序数据的个体识别验证。本发明的简易基因组组装的无参考基因组物种个体识别方法解决了传统RFID芯片在个体身份识别上的不足的问题,同时也解决了现有分子鉴定主要依赖STR和SNP位点扩增、前期需设计大量特异性引物并反复优化、过程繁琐且费时的问题,并且也同时针对无高质量参考基因组物种,建立了便捷、高效且成本低的个体识别方法,适用于濒危物种个体追踪以及非模式物种的研究,具有较高的普适性和实用性。
技术关键词
位点 识别方法 身份验证 序列 软件 基因组低深度测序 数据 遗传学技术 RFID芯片 坐标 样本 标记 字典 频率 脚本 引物 标志 索引 分子
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