摘要
本发明属于法医学和生物医药技术领域,公开了一种基于宏基因组学标志物用于水中尸体法医学鉴定的方法及应用,旨在解决现有溺死诊断准确性不足及死后淹没时间(PMSI)推断受限的问题。该方法包括:采集水中尸体肺组织及对应水域水样样本,采用宏基因组测序技术获取微生物DNA序列;通过生物信息学分析(如fastp质控、KneadData去除宿主序列、Kraken2物种注释)处理数据,结合随机森林算法及Boruta特征选择筛选种水平微生物标志物;基于筛选的标志物分别建立溺死诊断模型及PMSI推断模型,并通过AUC、MAE等指标验证模型性能。本发明首次全面解析水中尸体肺组织中细菌、真核生物(包括真菌)、古菌及病毒的完整微生物群落,筛选出17种细菌标志物、9种真核生物标志物用于溺死诊断(验证实验细菌模型AUC=1,准确率89.29%;真核生物模型AUC=0.95,准确率87.5%),以及17种标志物用于PMSI推断(整合模型MAE=0.66天)。该方法物种分辨率达种水平,不受扩增偏倚影响,适用于不同水域环境,为水中尸体的死因鉴定及死后淹没时间推断提供了高效、客观的法医学工具。
技术关键词
细菌检测试剂
生物标志物
豚鼠气单胞菌
原始测序数据
随机森林
布氏柠檬酸杆菌
简氏气单胞菌
弗氏柠檬酸杆菌
基因组测序技术
杀鲑气单胞菌
生物检测试剂
高通量测序平台
盘基网柄菌
构建测序文库
嗜水气单胞菌
特征选择算法
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