基于门控轴向自注意力机制的scRNA-seq数据细胞类型注释方法和系统

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基于门控轴向自注意力机制的scRNA-seq数据细胞类型注释方法和系统
申请号:CN202410708667
申请日期:2024-06-03
公开号:CN118522359A
公开日期:2024-08-20
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于门控轴向自注意力机制的scRNA‑seq数据细胞类型注释方法和系统,包括:对获取的scRNA‑seq数据进行预处理得到基因表达矩阵,然后进行基因集划分后进行嵌入表示操作得到输入张量;将输入张量分别输入针对查询、键和值均添加门控单元的水平注意力模块和竖直注意力模块中,分别计算得到水平注意力输出矩阵和竖直注意力输出矩阵,将水平注意力输出矩阵和竖直注意力输出矩阵进行融合;将融合后的输出矩阵通过全连接网络和激活函数后转换为细胞类型的概率分布,进而计算不同细胞的预测概率值以确定细胞类型。本发明能够高效、准确地注释来自不同平台和样本的未标记细胞,并有望发现新的细胞类型。
技术关键词
注释方法 注意力机制 线性变换矩阵 数据 基因表达定量 掩码矩阵 模块 注释系统 模型预训练 网络 计算机 因子 通道 标记 元素 序列 样本
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