一种基于GPU实现粒子间短程相互作用计算的方法

本发明属于分子动力学领域，具体涉及一种基于GPU实现粒子间短程相互作用计算的方法，包括：设计Map和Reduce两个操作符；对粒子空间进行网格划分，并预处理；对粒子划分区域；根据粒子编号、位置将粒子分配到GPU的每个线程上；选取S球域中的所有粒子，通过Map和Reduce操作计算S球域的近程力；随机均匀选取CS球域中的部分粒子，通过Map和Reduce操作计算CS球域的近程力；结合S球域的近程力和CS球域的近程力以及加入修正项计算粒子的实际近程力。本发明基于主流GPU架构高效实现了计算粒子短程相互作用时，通过球域划分引入随机受力，大幅减少近邻粒子数量来降低计算复杂度，很好的提升了计算效率。