基于Transformer模型预测的单细胞RNA测序数据聚类方法

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基于Transformer模型预测的单细胞RNA测序数据聚类方法
申请号:CN202410837824
申请日期:2024-06-26
公开号:CN118380048B
公开日期:2024-08-16
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于Transformer模型预测的单细胞RNA测序数据聚类方法,所述方法包括如下步骤:步骤1)获取单细胞RNA测序数据;步骤2)数据预处理;步骤3)基于PCA和K‑means的细胞簇类识别;步骤4)基于加权集成的元聚类方法处理;步骤5)计算投票置信度划分训练集;步骤6)引入基于Transformer模型的训练和预测。本发明的方法不仅能够克服现有方法在数据整合和一致性分析、细胞聚类的准确性和稳定性以及细胞聚类计算效率方面存在的问题,而且能够提高单细胞RNA测序数据分析的效率和准确性,准确识别和分类单细胞数据中的细胞类型,为细胞组学研究和生物医学应用提供更可靠的数据支持。
技术关键词
数据聚类方法 矩阵 层次聚类方法 基因表达数据 训练集数据 标签 定义 索引 代表 对象 算法 元素
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