一种混合鲸鱼优化和BP神经网络的拷贝数变异检测方法

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一种混合鲸鱼优化和BP神经网络的拷贝数变异检测方法
申请号:CN202410894101
申请日期:2024-07-04
公开号:CN118866085A
公开日期:2024-10-29
类型:发明专利
摘要
本发明公开一种混合鲸鱼优化和BP神经网络的拷贝数变异检测方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:数据的预处理,使用BWA软件将从NGS中获取的测序样本文件与参考序列进行比对,从而得到BAM文件,利用SAMtools从BAM文件中提取出Read Count配置文件;S2:特征提取,设置四个特征值(Ri,Gi,Ci,Qi),从读段信息中提取出来;S3:BP神经网络的构建;S4:改进鲸鱼优化算法,对鲸鱼优化算法算法进行改进。本发明涉及检测技术领域,具体地讲,涉及一种混合鲸鱼优化和BP神经网络的拷贝数变异检测方法。本发明要解决的技术问题是提供一种混合鲸鱼优化和BP神经网络的拷贝数变异检测方法,方便拷贝数变异检测。
技术关键词
鲸鱼优化算法 位置更新 特征值 结点 策略 优化BP神经网络 sigmoid函数 BP神经网络模型 GC偏差 模拟退火算法 鸟嘌呤 胞嘧啶 拷贝数 矩阵 代表 计算方法 交叉点 序列
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