一种识别微生物共现网络中关键集群的方法

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一种识别微生物共现网络中关键集群的方法
申请号:CN202410899588
申请日期:2024-07-05
公开号:CN118782157B
公开日期:2025-02-14
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种识别微生物共现网络中关键集群的方法,涉及微生物技术领域,采集、处理微生物菌群种数据,识别差异菌种,构建微生物共现网络;识别微生物共现网络中所有连通网络的个数,划分为识别模块和同构模块;采用社区发现算法对识别模块中的连通网络进行集群发现,得到结构特征相似的菌种集群,归纳同一集群的菌种特征,发现关键集群;针对同构模块中的连通网络,采用图匹配技术从识别模块的连通网络中匹配得到结构相似的子图,进一步发现关键集群。本发明最大限度地识别结构或功能相似的微生物集群,对小型微生物网络进行相似网络的匹配,结合菌群生物学特征分析这些集群潜在的关联机制和共同特征,以辅助基于微生物网络中相似集群的靶向干预。
技术关键词
识别模块 集群 菌种 社区发现算法 模块度优化方法 节点数 拓扑结构信息 聚合酶链式反应 测序接头 识别结构 文库 规模 网络结构 顶点 样本 数据 关系
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