一种基于机器学习和环境DNA技术的鱼类完整性指数评价水体健康状况的方法

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一种基于机器学习和环境DNA技术的鱼类完整性指数评价水体健康状况的方法
申请号:CN202410907586
申请日期:2024-07-08
公开号:CN118866124A
公开日期:2024-10-29
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于机器学习和环境DNA技术的鱼类完整性指数评价水体健康状况的方法,包括以下步骤:采集水样,提取水样中的eDNA并进行eDNA的扩增测序;基于鱼类线粒体基因组数据库对扩增后的子序列信息进行种类标注,获得候选指标,所述候选指标包括种类组成与丰度指标和多样性指数;基于候选指标构建鱼类生物完整性指数;基于随机森林算法对候选指标进行筛选,获得关键鱼类指标;将所述关键鱼类指标添加至所述候选指标中,获得优化后的鱼类生物完整性指数评估水体健康状况。本发明通过随机森林算法能够筛选出更具代表性和精准度的候选参数,从而优化F‑IBI指数的构建,增强了评价体系的科学性和实用性。
技术关键词
环境DNA技术 鱼类线粒体基因组 指数 指标 随机森林 评估水体 序列 扩增子 样本 表达式 剔除方法 算法 生物 生态系统 参数
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