一种基于密度曲线的DNA拷贝数检测方法及系统

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一种基于密度曲线的DNA拷贝数检测方法及系统
申请号:CN202410988904
申请日期:2024-07-23
公开号:CN118969068A
公开日期:2024-11-15
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于密度曲线的DNA拷贝数的检测方法及系统,涉及生物信息学技术领域,该方法包括以下步骤:分选单细胞或群体细胞后用全基因组预扩增或无预扩增所产生的DNA来构建测序文库;在特定分辨率下计算每个原始DNA测序数据的拷贝数信号值SNrc(SegmentedNormalized read counts);然后计算SNrc值的局部密度(Local density)并以此绘制密度曲线图;在密度图中找出主峰区(Majorpeak zone)和缓冲区(Bufferzone)分别作为整数型拷贝数(Integer copy number)和模糊值(Fuzzy value)。其中模糊值用以判断群体细胞组织样品中是否出现异质性或嵌合体,或单细胞样品是否出现游离DNA污染等问题。该方法提高了DNA拷贝数变异(CNV)判定的客观性和精准度。
技术关键词
拷贝数检测方法 密度 滑动窗口 生物信息学技术 分辨率 构建测序文库 序列 数据屏蔽 样本 平滑方法 染色体 分割算法 曲线 信号 分析模块 高通量
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