摘要
本发明公开了一种基于密度曲线的DNA拷贝数的检测方法及系统,涉及生物信息学技术领域,该方法包括以下步骤:分选单细胞或群体细胞后用全基因组预扩增或无预扩增所产生的DNA来构建测序文库;在特定分辨率下计算每个原始DNA测序数据的拷贝数信号值SNrc(SegmentedNormalized read counts);然后计算SNrc值的局部密度(Local density)并以此绘制密度曲线图;在密度图中找出主峰区(Majorpeak zone)和缓冲区(Bufferzone)分别作为整数型拷贝数(Integer copy number)和模糊值(Fuzzy value)。其中模糊值用以判断群体细胞组织样品中是否出现异质性或嵌合体,或单细胞样品是否出现游离DNA污染等问题。该方法提高了DNA拷贝数变异(CNV)判定的客观性和精准度。
技术关键词
拷贝数检测方法
密度
滑动窗口
生物信息学技术
分辨率
构建测序文库
序列
数据屏蔽
样本
平滑方法
染色体
分割算法
曲线
信号
分析模块
高通量
系统为您推荐了相关专利信息
识别通信信号
双谱特征
信号特征
分类网络
中频信号
监督学习算法
残差模块
卷积神经网络模型
网络模块
矿井
点云语义分割方法
点云密度
数据
网格
无人机航迹
空气隙结构
半导体结构
介质
通孔底部露出
插塞结构