一种临床宠物源大肠杆菌抗菌药物耐药表型预测方法及系统

本发明公开一种临床宠物源大肠杆菌抗菌药物耐药表型预测方法及系统，属于智能医学检验领域。对宠物源大肠杆菌样本进行抗菌药物的MIC测试和全基因组测序，分别得到MIC分类标签和泛基因组特征；筛选与MIC分类标签相关的泛基因组特征，得到最优特征组合；构建并优化前馈神经网络模型，得到抗菌药物优化预测模型；将最优特征组合输入抗菌药物优化预测模型，并输出抗菌药物的MIC预测结果；将MIC预测结果转化为SIR标签，确定抗菌药物的耐药表型。本发明从多个角度筛选出与耐药表型相关的泛基因组作为特征输入模型，并同时对MIC标签以及敏感、中介和耐药三分类的SIR标签进行预测，为宠物临床的细菌感染诊疗及后续研究提供助力。