基于同源搜索的微生物小蛋白注释方法

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基于同源搜索的微生物小蛋白注释方法
申请号:CN202411079563
申请日期:2024-08-07
公开号:CN118983008A
公开日期:2024-11-19
类型:发明专利
摘要
本发明公开了基于同源搜索的微生物小蛋白注释方法,属于微生物组以及宏基因组学技术领域,整合全球微生物组基因组及基因数据,利用同源比对对基因组或宏基因组中小蛋白的鉴定和注释。该注释方法,包括如下步骤:第一步、输入序列;第二步、同源比对;第三步、注释:结合所有的比对命中信息,基于已整理的全球微生物数组smORF注释数据,对得到的候选小蛋白序列进行物种分类、栖息地注释、功能结构域注释和质量控制信息匹配;第四步、输出。本发明基于自构建的全球微生物组smORF目录,利用同源比对方法对微生物基因组进行smORF预测和注释,降低预测的假阳性率,提高smORF预测的可信度。
技术关键词
注释方法 蛋白 序列 栖息地 开放阅读框 基因组学技术 灵敏度参数 数据 比对方法 目录 核苷酸 编码 命令 样本 算法 生物
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