摘要
本发明提供一种基于大豆相关的WD40基因进行比较进化分析的方法,涉及植物分子标记技术领域。该基于大豆相关的WD40基因进行比较进化分析的方法,具体包括以下步骤:S1.WD40基因家族成员的鉴定;S2.染色体分布特性;S4.系统发育分析;S5.Ka/Ks分析以及共线性分析;S6.基因结构、Motif、蛋白结构;S7.顺式调控元件分析。本发明的野生大豆与栽培大豆灰霉病和盐胁迫相关的WD40基因的挖掘与分析方法,是基于全基因组序列数据库,本发明利用生物信息学方法依据野生大豆与栽培大豆全基因组数据库分别鉴定出497、500个WD40家族成员,并对它们进行了基因特性及进化比较分析,分析结果将为今后通过基因工程手段增强栽培大豆抗灰霉病及耐盐特性,从而提高大豆产量及提升品质提供重要的参考价值。
技术关键词
分析野生大豆
系统发育树
调控元件
家族
基因组序列数据库
植物分子标记技术
蛋白
基因转录起始位点
软件
Linux系统
信息学方法
染色体
马尔可夫模型
基因工程手段
抗灰霉病
启动子
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Logistic函数
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强化学习策略
家族
样本
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基因
梯度提升模型
特征可视化方法
序列特征
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恶意软件分析
降维技术