摘要
本发明属生物信息学与计算生物学技术领域,涉及一种用于食管鳞癌分子分型的随机森林分类器及分子亚型分类器和构建方法。分子亚型为4个,分别为:ECMS 1、ECMS 2、ECMS 3、ECMS 4;特征为:ECMS 1:代谢通路异常,NFE2L2激活,选用药物适用NFE2L2抑制剂;ECMS 2:肿瘤经典信号通路上调,甲基化程度低;ECMS 3:拷贝数变异事件少,肿瘤突变负荷低,PD‑1高表达,对免疫抑制剂治疗获益;ECMS 4:上皮间质转化通路激活,总体生存率和无疾病生存率低,上皮间质转化和VEFG抑制剂治疗获益。本发明以解析食管鳞癌的异质性,统一各分型系统,从而实现分子分型更易推广。
技术关键词
食管鳞癌
拷贝数
分类器
分子
高通量测序数据
分型系统
原始测序数据
肿瘤突变负荷
启动子
随机森林
矩阵
基因转录起始位点
样本
测序接头
免疫抑制剂
网络融合方法
序列
谱聚类算法
系统为您推荐了相关专利信息
医疗文本分类方法
学习器
文本分类模型
异构
BiLSTM模型
纹波噪声
电信号
性能测量方法
序列
LMS滤波算法
个性化学习路径
英语专业
老年人
推荐系统
英语学习设备
孪生神经网络
活性预测方法
分子内相互作用
局部特征提取
蛋白质间相互作用
癫痫
Pearson相关系数
图像
定位方法
患者