碱基识别方法和系统

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碱基识别方法和系统
申请号:CN202411482436
申请日期:2024-10-22
公开号:CN119479831A
公开日期:2025-02-18
类型:发明专利
摘要
本申请提供碱基识别方法和系统。所称的碱基识别方法包括:通过基于神经网络的碱基识别器处理多个扩增子的输入数据并产生输入数据的替代表示,其中,输入数据包括扩增子在第n‑m1轮至第n+m2轮测序各自所采集的图像上的位置信息和强度信息,输入数据的文件大小小于其所对应的图像的文件大小,n为大于或等于1的自然数并且n大于m1,m1、m2各自独立地为大于或等于0的整数;通过输出层处理替代表示以产生输出,其中,输出识别第n轮测序引入到各个所述扩增子中的碱基为A、C、T和G的概率;和基于输出确定第n轮测序引入到各个所述扩增子中的碱基类型。该方法能够高效地处理输入数据并且获得准确的碱基识别结果。
技术关键词
扩增子 语义分割模型 碱基识别方法 识别器 图像 计算机可执行程序 描述符 梯度提升决策树 注意力 混合损失函数 机器学习模型 通道 模板 数据 上采样 编码器 解码器结构 半监督学习方式 模块 矩阵
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