摘要
公开了一种利用大规模基因组注释信息提高猪复杂性状基因组选择准确性的方法,包括整合参考群猪只基因组的多个功能注释及其位置信息;提取多个功能注释区域的SNPs数据并构建功能注释的基因组亲缘关系矩阵A;估计每个基因组亲缘关系矩阵A的方差组分,基于方差组分对多个功能注释进行排序,合并多个功能注释并得到功能注释集;删除功能注释集中的重复SNPs数据并构建功能注释集的基因组亲缘关系矩阵B,计算功能注释集的随机遗传效应值以得到猪估计的基因组育种值。本申请通过提取猪复杂性状的多种基因组功能注释,通过拟合包含多个随机遗传效应的混合线性模型得到基因组育种值,提高了猪基因组育种值预测的准确性和时效性。
技术关键词
混合线性模型
全基因组关联分析
矩阵
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关系
效应
位点
数据
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