基于Overlapping Group Lasso开发的单细胞通路分析方法

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基于Overlapping Group Lasso开发的单细胞通路分析方法
申请号:CN202411634758
申请日期:2024-11-15
公开号:CN119694408A
公开日期:2025-03-25
类型:发明专利
摘要
本发明提出一种基于Overlapping Group Lasso开发的单细胞通路分析方法,使用该模型的Logistics形式对每个细胞的基因表达数据与细胞状态进行回归;采用Stability Selection算法,对数据采用多次抽样回归并保留筛选频率最稳定的通路作为最终结果;具体包括步骤如下:步骤一:对输入细胞基因表达矩阵、通路数据和细胞的标签进行数学表达和预处理;步骤二:建立回归模型;步骤三:求解回归模型;步骤四:稳定性选择。模型筛选出以通路为单位的自变量组,并且基于Overlapping Group Lasso的特性,分解了重叠基因在不同基因组中的效应,有效避免了重叠基因效应带来的影响。
技术关键词
通路分析方法 基因表达数据 梯度下降算法 矩阵 效应 频率 非光滑 变量 数学 标签 参数 标记 做法 噪声 线性 样本 元素
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