压缩和解压缩FASTQ文件的方法和装置

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压缩和解压缩FASTQ文件的方法和装置
申请号:CN202411637800
申请日期:2024-11-15
公开号:CN119832997A
公开日期:2025-04-15
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种压缩和解压缩FASTQ文件的方法和装置。其中,该方法包括:将所述FASTQ文件中同一读段的4行信息转化为1行信息,得到的不同读段的所述1行信息顺序排列,输出为新的文本文件;新的文本文件中的同一读段的1行信息以从左到右的顺序依次为:第一列读段ID号信息、第二列读段序列信息、第三列ASCII码信息;利用gzip对新的文本文件进行压缩,完成FASTQ文件的压缩。对FASTQ文件中的4行信息进行信息缩减的转化,尤其是有关读段序列信息的简化,能够得到压缩比较高的基因测序信息,为基因测序数据的存储和运输提供便利。
技术关键词
解压缩方法 序列 矩阵 解压缩装置 转换单元 代表 基因测序数据 芯片 拼接单元 模块 标记 处理器 坐标 对象 介质 程序
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