摘要
本发明涉及了生物计算技术领域,具体涉及了基于可解释深度学习的层级式TADs结构域识别方法及系统,方法包括:获取Hi‑C接触矩阵,提取其中基本TADs结构域边界点,依据边界点与最大TADs结构域限制条件生成各层级候选层级式TADs结构域。接着以Hi‑C接触矩阵中任意两个染色质片段与所有候选层级式TADs结构域的位置关系、以及两个片段之间的基因组距离为输入,以两个片段之间的相互作用频率为输出训练深度学习模型。然后对深度学习模型进行解释,根据各候选层级式TADs结构域对全体接触频率的贡献度筛选出最显著的层级式TADs结构域。此流程有助于量化每个TADs结构域对整个Hi‑C接触矩阵的重要性,为基因组三维结构研究等提供重要依据。
技术关键词
层级
识别方法
训练深度学习模型
矩阵
频率
生物计算技术
Sigmoid函数
关系
数据处理模块
三维结构
识别系统
优化器
基准
算法
元素
尺寸
线性
系统为您推荐了相关专利信息
深度学习模型
卷积特征
模型训练方法
注意力
非易失性存储介质
病虫害识别方法
集成分类器
图像处理
编码器模块
植物叶片图像
信号特征提取方法
有载分接开关
纹理分析方法
分段
梯度共生矩阵
风电机组
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发电机轴承
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神经网络模型