基于可解释深度学习的层级式TADs结构域识别方法及系统

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基于可解释深度学习的层级式TADs结构域识别方法及系统
申请号:CN202411843793
申请日期:2024-12-14
公开号:CN119694404A
公开日期:2025-03-25
类型:发明专利
摘要
本发明涉及了生物计算技术领域,具体涉及了基于可解释深度学习的层级式TADs结构域识别方法及系统,方法包括:获取Hi‑C接触矩阵,提取其中基本TADs结构域边界点,依据边界点与最大TADs结构域限制条件生成各层级候选层级式TADs结构域。接着以Hi‑C接触矩阵中任意两个染色质片段与所有候选层级式TADs结构域的位置关系、以及两个片段之间的基因组距离为输入,以两个片段之间的相互作用频率为输出训练深度学习模型。然后对深度学习模型进行解释,根据各候选层级式TADs结构域对全体接触频率的贡献度筛选出最显著的层级式TADs结构域。此流程有助于量化每个TADs结构域对整个Hi‑C接触矩阵的重要性,为基因组三维结构研究等提供重要依据。
技术关键词
层级 识别方法 训练深度学习模型 矩阵 频率 生物计算技术 Sigmoid函数 关系 数据处理模块 三维结构 识别系统 优化器 基准 算法 元素 尺寸 线性
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