摘要
本发明涉及一种高通量基因测序的并行处理同步优化方法及系统。该方法:对多个DNA样本进行通道分配及信号采集初始化,得到信号采集参数矩阵;对各通道采集的荧光信号进行特征提取和聚类分析,得到DNA碱基特征序列和信号分类概率矩阵;通过凸优化算法对测序周期的短期参数进行动态调整,通过整数规划算法对长期测序性能进行优化,得到测序参数优化集和测序周期分配策略;将所述测序参数优化集和所述测序周期分配策略输入双层嵌套控制模型,并通过上层资源分配网络和下层参数优化网络进行联合求解,得到全局优化控制参数集。本发明的实施提升了测序准确率,并且实现了计算资源利用率的提升。
技术关键词
高通量基因测序
矩阵
参数
序列
凸优化算法
多维特征数据
资源分配模块
概率密度函数
信号
规划算法
误差补偿单元
状态转换概率
周期
分配单元
网络
聚类
样本
策略
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