基于LSTM模型的抗菌肽序列的抗菌活性预测方法及系统

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基于LSTM模型的抗菌肽序列的抗菌活性预测方法及系统
申请号:CN202411917560
申请日期:2024-12-24
公开号:CN120072028A
公开日期:2025-05-30
类型:发明专利
摘要
本申请涉及一种基于LSTM模型的抗菌肽序列的抗菌活性预测方法及系统,方法包括:构建训练样本训练集,样本训练集包括正样本集和负样本集,正样本集包括经过预处理的目标菌属的抗菌肽序列,负样本集包括经过预处理的非抗菌肽序列;利用预训练的蛋白质语言模型提取样本训练集的第一高维嵌入特征;以样本训练集的抗菌活性作为标签,利用第一高维嵌入特征对初始的LSTM模型进行训练,得到训练好的LSTM模型;利用蛋白质语言模型提取待预测的抗菌肽序列的第二高维嵌入特征,将第二高维嵌入特征输入至训练好的LSTM模型,输出待预测的抗菌肽序列的抗菌活性。本申请显著提升抗菌活性预测的准确性。
技术关键词
嵌入特征 抗菌肽 抗菌活性预测 样本 LSTM模型 训练集 标签 模型训练模块 特征提取模块 数据处理模块 序列特征 计算误差 传播算法 处理器 计算机设备 优化器 可读存储介质 存储器
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