基于蛋白质语言模型的非模式物种代谢模型自动构建方法

一种基于蛋白质语言模型的非模式物种代谢模型自动构建方法，采用了基于预训练大模型的基因同源关系推断方法，与蛋白质序列比对方法相结合，构建得到不同物种的基因同源关系；以模式生物的GEMs为模板，基于基因同源关系与非同源基因注释结果构建非模式生物的GEMs，再经反应缺口填补(gap filling)实现代谢模型结构优化。本发明能够显著提高基因同源关系的准确性，提高非模式生物GEMs构建速度、质量以及最终模型的预测性能。