一种基于蛋白质尺寸提示的自监督学习预训练方法和系统

本发明公开一种基于蛋白质尺寸提示的自监督学习预训练方法和系统，首先从蛋白质数据库中收集未经标注的蛋白质数据；利用尺寸提示适配器，将蛋白质尺寸信息编码为提示向量，并嵌入到蛋白质编码器中；然后基于蛋白质的图或点云表示，执行掩码预测任务完成预训练；最后，在下游任务中对预训练模型进行微调，优化其特定任务表现。本发明通过蛋白质尺寸提示显著减少了预训练和下游任务之间数据分布不一致的问题，从而提升了预训练模型的通用性和下游任务的性能。本方法具有数据高效性、模型通用性及易扩展性，适用于蛋白质功能预测、结合位点检测等多种任务。