摘要
本发明公开了一种基于大语言模型和图像表征的药物‑靶点相互作用预测方法,使用大语言模型ESM‑2编码靶点序列,使用大语言模型X‑MOL编码药物SMILES,生成特征矩阵,通过图像表征技术生成药物和靶点的二维图像表征;构建药物‑靶点相互作用预测模型MapCPI,将药物和靶点的二维图像表征输入MapCPI,得到药物‑靶点相互作用预测概率,判断药物‑靶点是否发生结合。模型利用这些编码信息,不依赖于靶点结构信息即可有效提取药物‑靶点相互作用特征,从而实现对药物‑靶点相互作用的预测,并且展现出良好的泛化性能。本发明通过结合大语言模型和图像表征技术提高了药物‑靶点相互作用预测的准确度和效率。
技术关键词
大语言模型
药物
图像
表征技术
双通道卷积神经网络
编码
矩阵
相互作用特征
蛋白
生物活性化合物
生成特征
靶点结构
投影算法
模板
序列
基准
数据
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