摘要
本发明公开了一种利用CRISPR筛选Th17细胞异质性的调节因子的高通量方法,涉及CRISPR筛选技术领域,该方法包括如下步骤:CRISPR文库构建;Il17aCreRosa26YFP/Cas92D2T细胞转导;体内移植与EAE模型构建;单细胞转录组测序与单细胞CRISPR筛选。本发明利用CRISPR‑Cas9技术的高通量能力显著提升筛选效率,提高Th17细胞异质性调控转录因子检出的可能性和准确率:利用Il17aCreRosa26YFP/Cas92D2细胞,其中IL‑17a‑Cre的表达控制YFP和CAS9的表达,确定YFP+、Thy1.1+细胞是sgRNA转导的Th17细胞,因此,只有YFP+、Thy1.1+、Th17或ex‑Th17细胞中的基因才会被编辑,从而提高筛选的特异性和效率,并且可选用不同范围sgRNA文库,覆盖全基因或者转录因子范围,通过体内实验模型更接近真实免疫环境,结果更具生物学意义,可为自身免疫疾病的诊断和治疗提供全新的靶点和干预策略。
技术关键词
高通量方法
单细胞转录组
转录因子
逆转录病毒载体
基因表达数据
转录组文库
筛选技术
试剂盒
小鼠模型
全基因
免疫细胞
编辑
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