摘要
本发明提出了一种基于分子‑基因相互作用约束图卷积网络的HBV抑制剂筛选方法。针对传统药物发现方法在处理复杂生物学数据时的局限性,本发明基于所构建的抗HBV体外活性验证的化合物库、对应化合物关联的多个基因靶标及其互作网络,利用图卷积网络模型的图数据处理能力,构建了分子‑基因相互作用约束图卷积网络模型。该模型结合基因对应的靶标蛋白的相互作用矩阵、基因特征矩阵和化合物活性标签,有效预测化合物的生物活性类别。具体步骤包括数据处理、图数据生成、图卷积网络模型训练、超参数优化和模型评估。模型参数AUC值0.97,模型效果好。本发明为抗HBV药物的虚拟筛选提供了新的路径和思路,具有潜在的应用价值。
技术关键词
抑制剂筛选方法
卷积网络模型
靶标相互作用
基因
毒性测试
分子
药物发现方法
HBV抑制剂
节点特征
训练预测模型
损失函数优化
标签
化合物库
超参数
训练集
矩阵
指标
数据
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训练集
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