摘要
本发明公开一种用于牛品种及亲子鉴定的5k液相芯片的制备方法及应用。基于目标牛品种集合和扩增牛品种集合中牛品种的原始基因组数据,获取各品种基因组SNP位点的位置信息,然后通过Delta、FST值方法筛选具有品种特异性或高遗传稳定性的位点;结合机器学习分类模型对品种进行分类,获得符合要求的特异性位点组合作为目标SNP位点组合。获得的SNP位点组合不仅在对目标品种进行品种鉴定时能够达到100%鉴定准确率,实现高效、低成本、大规模、自动化进行品种及亲子鉴定;还能有效判断被测牛的生产类型,能够更好地辅助牧场选择乳肉兼用牛,增加整体奶产量、奶品质,提高收益。
技术关键词
SNP位点组合
机器学习分类模型
液相
位点筛选方法
芯片
核苷酸
混合液
双链探针
朴素贝叶斯
染色体
检测试剂盒
重复序列
随机森林
生物素
包装
系统为您推荐了相关专利信息
芯片检测装置
滑动部件
缓冲部件
压紧机构
压力传感器
电阻式存储器
氧化铪薄膜
叠层结构
氧化锆薄膜
复合薄膜
智能助眠枕
信号收发器
柔性压力传感器
压力感应机构
FPC排线
焊盘组件
芯片安装区域
发射组件
金属化
安装热敏电阻