基于知识图谱的药物组合协同作用预测方法及系统

本发明公开了一种基于知识图谱的药物组合协同作用预测方法及系统，该方法利用蛋白质、药物、细胞系和组织之间的关系构建大规模知识图谱。将药物和细胞系的邻居节点嵌入与自身嵌入相结合，得到药物和细胞系的全局表示。采用RDkit来计算每个药物的指纹和基于SMILES表达式的描述符，得到药物的局部表示。利用自动编码器对细胞系的基因表达数据进行降维，获得细胞系的局部表示。融合药物和细胞系的局部表示，利用深度神经网络来预测药物组合的协同分数。本发明充分挖掘知识图谱中复杂语义关系，提升模型对潜在药物组合的理解能力；同时引入局部分子特性和全局网络拓扑信息，提供更全面的药物和细胞系表征，增强了预测模型的鲁棒性。