摘要
本发明公开了黄鱼抗菌肽L‑AMPs,本发明采用了支持向量机(SVM)、随机森林(RF)、人工神经网络(ANN)判别算法,对来源于黄鱼的136种蛋白肽片段进行筛选,首次在黄鱼蛋白片段中发现了三种安全有效的抗菌肽片段,并且在SVM、RF、ANN三种判别方法下均具有较高的抗菌性,同时经毒理学验证,上述三种黄鱼抗菌肽对机体有着较高的安全性,经黄鱼蛋白分解或合成、量产后,可作为天然抑菌剂、活性功能成分在各领域内应用。经筛选得到的三种黄鱼抗菌肽分别为:氨基酸序列是KNYKY,SEQ ID NO.1;氨基酸序列是KMVAR,SEQ ID NO.2;氨基酸序列是FAMRK,SEQ ID NO.3。
技术关键词
抗菌肽
人工神经网络
判别算法
序列
牙龈卟啉单胞菌
支持向量机
蛋白
随机森林
天然抑菌剂
金黄色葡萄球菌
判别方法
肽聚糖
多糖
生理
机体
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