抗菌肽序列生成方法、系统、电子设备及存储介质

本申请实施例提供了一种抗菌肽序列生成方法、系统、电子设备及存储介质，属于蛋白质设计技术领域。该方案通过获取多肽氨基酸序列和抗菌肽氨基酸序列；基于多肽氨基酸序列对生成式预训练模型进行训练，得到多肽大模型；基于抗菌肽氨基酸序列对多肽大模型进行对比提示学习，得到抗菌肽提示模型；对抗菌肽提示模型进行知识蒸馏，得到蒸馏模型；获取抗菌肽设计需求；将抗菌肽设计需求作为强化学习的奖励分数，通过强化学习方法对蒸馏模型的模型参数进行调整，得到抗菌肽生成模型；基于训练好的抗菌肽生成模型，通过自回归方式生成目标抗菌肽序列，本申请能够根据需求生成具备期望性质且结构新颖的抗菌肽，提高抗菌肽设计中活性抗菌肽比例和多样性。