基于细胞-基因异质二分图的单细胞数据表达谱重建方法及相关设备

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基于细胞-基因异质二分图的单细胞数据表达谱重建方法及相关设备
申请号:CN202510291647
申请日期:2025-03-12
公开号:CN120220830A
公开日期:2025-06-27
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于细胞‑基因异质二分图的单细胞数据表达谱重建方法及相关设备,属于生物信息技术领域,所述方法包括:构建细胞‑基因异质二分图并通过图神经网络编码器更新不同类型的基因节点和细胞节点的嵌入,得到初始细胞节点表示和初始基因节点表示;基于初始细胞节点表示和初始基因节点表示构建整个图上两类节点的全局表示和封闭子图上节点的局部表示,并输入至噪声对比损失函数内通过判别器评分,得到细胞节点嵌入和基因节点嵌入并输入至矩阵分解模型,优化其目标函数后,输出重建后的单细胞数据表达谱。本发明能够解决现有技术在重建单细胞数据表达谱时无法保留更多原始信息,从而无法精准识别细胞亚群和反映细胞状态的问题。
技术关键词
基因 节点 矩阵分解模型 异质 编码器 噪声 数据 计算机程序产品 生物信息技术 样本 随机梯度下降 处理器 可读存储介质 重建系统 注意力机制 模块 存储器 电子设备
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