摘要
一种面向scRNA‑seq数据的轻量级最优聚类选择方法,包括步骤:1.获取并预处理scRNA‑seq数据矩阵。2.利用多层感知机编码器逐层降维数据,获取低维特征矩阵。3.构建无向细胞图,并通过NE网络增强去除细胞图噪声。4.使用图卷积重构特征,将低维特征矩阵与细胞图输入到简化图卷积模块中,逐轮更新重构特征矩阵。5.使用自优化聚类对每一轮更新后的特征矩阵进行细胞聚类,获得细胞表示。6.对当前轮次的聚类性能进行判断评估,保存最优的聚类结果,并进行下一轮特征重构建和自优化聚类。7.输出最终的最优特征信息并分析。本发明能够很好地处理scRNA‑seq数据,提取低维嵌入特征,预测标签更为准确,且对硬件资源需求较低,为解析单细胞数据的生物学特性提供了一种高效的方法。
技术关键词
矩阵
多层感知机
Pearson相关系数
轮廓系数
基因表达特征
卷积模块
基因表达数据
多头注意力机制
邻域
KNN算法
聚类特征
卷积模型
嵌入特征
标签
判别方法
重构
编码器
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多尺度特征融合
跨模态
编码器模块
多层感知机
图像分割模型
热扩散模型
三角网格曲面
偏置方法
曲线
德洛内三角剖分
装备故障诊断方法
数据
在线故障诊断
协方差矩阵
特征值
协方差矩阵
DOA估计
估计方法
信号源
阵列天线