一种面向scRNA-seq数据的轻量级最优聚类选择方法

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一种面向scRNA-seq数据的轻量级最优聚类选择方法
申请号:CN202510328867
申请日期:2025-03-19
公开号:CN120145083A
公开日期:2025-06-13
类型:发明专利
摘要
一种面向scRNA‑seq数据的轻量级最优聚类选择方法,包括步骤:1.获取并预处理scRNA‑seq数据矩阵。2.利用多层感知机编码器逐层降维数据,获取低维特征矩阵。3.构建无向细胞图,并通过NE网络增强去除细胞图噪声。4.使用图卷积重构特征,将低维特征矩阵与细胞图输入到简化图卷积模块中,逐轮更新重构特征矩阵。5.使用自优化聚类对每一轮更新后的特征矩阵进行细胞聚类,获得细胞表示。6.对当前轮次的聚类性能进行判断评估,保存最优的聚类结果,并进行下一轮特征重构建和自优化聚类。7.输出最终的最优特征信息并分析。本发明能够很好地处理scRNA‑seq数据,提取低维嵌入特征,预测标签更为准确,且对硬件资源需求较低,为解析单细胞数据的生物学特性提供了一种高效的方法。
技术关键词
矩阵 多层感知机 Pearson相关系数 轮廓系数 基因表达特征 卷积模块 基因表达数据 多头注意力机制 邻域 KNN算法 聚类特征 卷积模型 嵌入特征 标签 判别方法 重构 编码器
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