一种用于识别RNA甲基化位点的预测方法

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一种用于识别RNA甲基化位点的预测方法
申请号:CN202510428519
申请日期:2025-04-08
公开号:CN120299525A
公开日期:2025-07-11
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种用于RNA甲基化位点预测的方法,基于多模态特征融合与语义向量嵌入技术,显著提高m7G修饰位点的识别精度。首先,构建包含正负样本的RNA序列数据集,并按预定比例划分为训练集与独立测试集。然后,通过独热编码(One‑hot)、核苷酸化学性质编码(NCP)、电子‑离子相互作用电位编码(EIIP)以及局部核苷酸组成编码(ENAC)提取多模态特征,结合DNA2Vec模型获取核苷酸序列的上下文语义信息。模型采用多模态特征融合通路(MRF)与DNA2Vec嵌入通路,经过全连接层进行特征维度压缩后,利用Transformer编码器捕获长程依赖关系,并通过Sigmoid激活函数计算预测概率。在优化过程中,采用批量归一化、Dropout及Adam优化器,最小化二元交叉熵损失函数。最终,通过五折交叉验证评估模型性能,并在独立测试集上验证其泛化能力。该方法通过多源特征融合与层次化建模,显著提升了序列信息的解析能力,为RNA修饰预测提供了一个精确的计算工具。
技术关键词
多模态特征融合 上下文语义信息 多源特征融合 核苷酸 语义向量 位点 序列 模型优化方法 跨模态 编码器模块 优化器 深度神经网络 压缩特征 通道 样本 编码方案
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