一种基于全基因组关联性分析筛选疾病相关基因靶点的方法

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一种基于全基因组关联性分析筛选疾病相关基因靶点的方法
申请号:CN202510444748
申请日期:2025-04-10
公开号:CN120340596A
公开日期:2025-07-18
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种基于全基因组关联分析筛选疾病相关基因靶点的方法,属于疾病遗传风险评估技术领域,所述方法包括以下步骤:收集并记录样本信息数据集;将样本进行全基因组测序,获得SNP数据,合并所有样本SNP数据,获得训练数据集;对SNP矩阵进行主成分分析,筛选排名前10~30的SNP作为模型的协变量;对训练数据集进行全基因组关联分析并构建逻辑回归模型,根据P值筛选出与患病相关的SNP。本发明采用逻辑回归模型通过引入协变量(如年龄、性别、周运动次数),能够有效控制混杂因素,并通过正则化方法处理高维数据,降低过拟合的风险。所述方法还能够捕捉SNP之间的交互作用,提供更精确的疾病相关SNP识别。
技术关键词
全基因组关联分析 逻辑回归模型 疾病相关基因 样本 成分分析 基因组测序数据 遗传风险评估 正则化方法 变量 位点 年龄 编码 矩阵 运动 男性 女性 基准
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