一种基于结构感知的蛋白质-配体结合亲和力预测方法及系统

一种基于结构感知的蛋白质‑配体结合亲和力预测方法及系统，属于生物信息学与药物研发领域。为了现有的亲和力预测解决忽视了蛋白质‑配体复合物的结构模态信息导致亲和力预测的准确性低的问题。本发明对蛋白质序列和配体SMILES字符串进行整数编码，并得到序列预测值；将蛋白质结合口袋‑配体复合物表示为异构图，对蛋白质‑配体复合物异构图进行编码，进而得到节点特征和边特征对应的预测值；基于异构图并采用“蛋白质原子‑配体原子‑蛋白质原子”和“配体原子‑蛋白质原子‑配体原子”两条元路径分别生成同构图，针对元路径的同构图进行编码，并得到两条元路径对应的融合特征，进而得到对应的预测值；基于所有预测值得到最终的预测值。