摘要
本发明涉及一种果胶甲基酯酶二肽抑制剂设计方法,包括:通过分子对接算法对候选二肽化合物进行虚拟筛选处理,获得候选二肽抑制剂;对候选二肽抑制剂与果胶甲基酯酶的分子对接的三维结构结果进行分析,构建二肽抑制剂与酶复合物的相互作用模型;利用分子动力学模拟算法对所述相互作用模型进行稳定性分析,获得稳定性分析结果;根据所述稳定性分析结果计算二肽抑制剂与酶复合物的结合能,根据所述结合能对所述候选二肽抑制剂进行筛选,获得果胶甲基酯酶二肽抑制剂。本发明能够提高筛选效率,降低实验成本。
技术关键词
果胶甲基酯酶
二肽
相互作用模型
三维结构
复合物
分子
氢键相互作用
疏水相互作用
轨迹
序列
温度平衡
算法
复合结构
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