摘要
本发明公开一种可解释性机器学习基因组预测方法及装置,属于生物育种、生物信息与机器学习结合技术领域,利用先进的机器学习算法,结合生物学先验信息进行参数优化,通过处理多源数据(基因组、转录组、表观遗传数据)、动态特征工程(PCA与PHATE降维)、多种机器学习模型有机结合,以及基于网格搜索与麻雀搜索算法的自动化调参框架,显著提升基因组预测精度与计算效率;同时,基于SHAP值实现模型的可解释性,量化SNP位点贡献,为精准育种提供参考,适用于动植物分子育种和医学遗传分析,可加速高价值性状的遗传解析,辅助精准育种决策与疾病风险预测,推动“经验育种”向“智能育种”的跨越式发展。
技术关键词
位点
全基因组关联分析
特征选择
机器学习训练
模型超参数
模型训练模块
超参数优化方法
机器学习算法
机器学习模型训练
搜索算法
皮尔逊相关系数
非线性结构
数据缺失值
梯度提升树
K近邻算法
矩阵
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妊娠期糖尿病
早期预测方法
孕妇
特征选择
机器学习算法
网络
正则化方法
进化算法
带电作业技术
健康监测数据
储氢材料
材料数据库
特征选择
关系
支持向量机模型
空间多尺度
注意力机制
泛化方法
二进制特征
分类器
股骨大转子
CT三维重建
参数测量方法
三维模型
原位