一种可解释性机器学习基因组预测方法及装置

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一种可解释性机器学习基因组预测方法及装置
申请号:CN202510501375
申请日期:2025-04-21
公开号:CN120564828A
公开日期:2025-08-29
类型:发明专利
摘要
本发明公开一种可解释性机器学习基因组预测方法及装置,属于生物育种、生物信息与机器学习结合技术领域,利用先进的机器学习算法,结合生物学先验信息进行参数优化,通过处理多源数据(基因组、转录组、表观遗传数据)、动态特征工程(PCA与PHATE降维)、多种机器学习模型有机结合,以及基于网格搜索与麻雀搜索算法的自动化调参框架,显著提升基因组预测精度与计算效率;同时,基于SHAP值实现模型的可解释性,量化SNP位点贡献,为精准育种提供参考,适用于动植物分子育种和医学遗传分析,可加速高价值性状的遗传解析,辅助精准育种决策与疾病风险预测,推动“经验育种”向“智能育种”的跨越式发展。
技术关键词
位点 全基因组关联分析 特征选择 机器学习训练 模型超参数 模型训练模块 超参数优化方法 机器学习算法 机器学习模型训练 搜索算法 皮尔逊相关系数 非线性结构 数据缺失值 梯度提升树 K近邻算法 矩阵
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