一种基于核酸与蛋白相互作用的分子动力学模拟方法

本发明涉及一种基于核酸与蛋白相互作用的分子动力学模拟方法，包括：对目标核酸序列进行分子建模，得到核酸三维结构模型；根据同源模板与深度学习方法对目标蛋白质序列进行结构预测，得到蛋白质三维结构模型；利用分子对接算法对所述核酸三维结构模型与所述蛋白质三维结构模型进行相互作用位点筛选，得到核酸与蛋白质的复合物初始构象；基于多阶段能量最小化与系综平衡条件，对所述复合物初始构象进行动力学模拟，得到构象轨迹数据；对所述构象轨迹数据进行多维度分析，得到核酸与蛋白相互作用的量化指标。本发明提升了建模精度，并且减少人工干预，提升了模拟效率。