摘要
本发明提供植物根尖单细胞空间转录组三维重构的方法,所述方法包括以下步骤:a. 基于X射线成像显微技术对第一植物根尖进行三维成像,获得X射线成像显微数据;b. 基于Stereo‑seq对第二植物根尖的一个或多个冷冻切片的转录组进行捕获与分析,获得所述第二植物根尖的空间组数据;c. 提取第三植物根尖的细胞核,并获得所述第三植物根尖的snRNA‑seq数据;d. 对Stereo‑seq数据和snRNA‑seq数据分别进行预处理,并将预处理后的Stereo‑seq数据和snRNA‑seq数据进行整合及注释;e. 将X射线成像显微数据与获得的整合及注释后的数据进行空间配准与整合,获得植物根尖的单细胞空间转录组三维重构图。
技术关键词
X射线成像
乙醇
冷冻切片
Louvain算法
单细胞转录组数据
真空渗透
组织
丙酮
显微技术
脱水干燥方法
条码
三维成像
基因表达数据
差异表达基因
空间坐标信息
分辨率
DNA纳米
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指标分析方法
节点
关系网络
Louvain算法
社团划分算法
急性胰腺炎
最佳提取工艺
超声功率
牛磺胆酸钠
乙醇
神经根型颈椎病
DCS控制系统
单效浓缩器
挥发油
双效浓缩器
乙醇
偏差
浓度在线监测系统
深度学习算法
长短期记忆网络
倒装芯片结构
固液相变材料
腔体
强化表面结构
基板