摘要
本发明公开了一种基于边加权图注意力与多视图对比学习的空间转录组数据分析方法,包括:对空间转录组数据进行预处理,得到预处理后的空间转录组数据;其中空间转录组数据包括组织学信息、基因表达信息和空间位置信息;基于预处理后的空间转录组数据,构建细胞邻接矩阵、扰动矩阵以及基因共表达矩阵;基于细胞邻接矩阵、扰动矩阵以及基因共表达矩阵,构建多视图对比学习框架,多视图包括正视图、空间视图和负视图;通过边加权图注意力自编码器将多视图映射到统一的潜在表示空间,得到节点嵌入;基于节点嵌入进行下游分析。本发明能够在空间转录组数据分析中准确识别不同空间结构模式,从而提高空间数据的聚类准确性、紧凑性和可分离性。
技术关键词
矩阵
数据分析方法
注意力
编码器
节点
近邻算法
标记基因
洗牌
框架
重构
空间结构
采样点
列表
解码器
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