摘要
本发明公开了葡萄果实纵径全基因组选择育种方法,包括以下步骤:获取323份葡萄样本的变异位点数据与表型数据;将323份样本划分成训练集和测试集,其中训练集259份样本,测试集64份样本;对训练集样本进行全基因组关联分析,找到与果实纵径显著关联的变异位点;将关联的变异位点和表型数据导入5种经典的回归模型中,进行预测葡萄纵径大小的模型训练,筛选出最佳预测模型;将64份测试集的变异位点数据集导入筛选出的最佳预测模型进行预测,评估模型准确性。本发明涉及育种筛选技术领域。基于5000个变异位点和Ridge回归模型,在64个测试样本中,模型预测值与实际表型值的线性相关系数达到了R=0.96,表明模型可替代人工检测的水平。
技术关键词
二代测序数据
全基因组关联分析
位点
葡萄
果实
基因组二代测序
样本
混合线性模型
支持向量回归
模型预测值
筛选技术
软件
多项式
训练集
叶片
接头
网络
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