一种宏基因组分箱分析环境微生物群落的优化方法

本发明公开了一种宏基因组分箱分析环境微生物群落的优化方法，包括：收集环境微生物群落样本，提取DNA，测序生成reads，进行k‑mer特征标签计算和聚类分析；对每个样本的reads进行质控，clean reads组装生成长的contigs；将测序reads比对到contigs上生成包含每个contig reads覆盖信息的BAM文件；结合覆盖度信息和序列组成特征对每个分组内的样本集进行分箱。本发明一方面通过比较不同样本间的覆盖度模式提高分箱的准确性，有效识别污染物Contigs和嵌合bin，减少隐藏污染；另一方面通过集成多种生物信息学工具和算法，实现对环境微生物群落宏基因组数据高效、准确分析。