摘要
本申请公开了一种基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质,属于生物信息技术领域。所述方法包括以下步骤:将具有细胞类型注释的单细胞组学数据按细胞类型拆分,将同一细胞类型的细胞聚类并生成元细胞,获得元细胞特征计数矩阵;计算各细胞类型相对于其他细胞类型特异性的标志特征;计算各细胞类型标志特征的基矩阵,并基于待注释的空间组学数据的特征计数矩阵,计算每个空间位置对应的细胞类型权重值,取权重值最高的细胞类型作为该空间位置的细胞类型注释。利用本申请的方法、设备或介质进行空间细胞类型注释,大幅度减少了分析过程的计算量,提高了分析效率,增加了注释的准确性和稳定性。
技术关键词
注释方法
标志
矩阵分解算法
生物信息技术
数据
可读存储介质
转录组学
存储计算机程序
计算机设备
处理器
聚类
存储器
系统为您推荐了相关专利信息
文本理解
sigmoid函数
企业
数据特征提取
客户流失预测方法
特征选择技术
人类
气候变化情景
模拟模型
灰色预测模型