基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质

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基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质
申请号:CN202510814919
申请日期:2025-06-18
公开号:CN120319326B
公开日期:2025-10-10
类型:发明专利
摘要
本申请公开了一种基于元细胞的空间转录组细胞类型注释方法、设备和介质,属于生物信息技术领域。所述方法包括以下步骤:将具有细胞类型注释的单细胞组学数据按细胞类型拆分,将同一细胞类型的细胞聚类并生成元细胞,获得元细胞特征计数矩阵;计算各细胞类型相对于其他细胞类型特异性的标志特征;计算各细胞类型标志特征的基矩阵,并基于待注释的空间组学数据的特征计数矩阵,计算每个空间位置对应的细胞类型权重值,取权重值最高的细胞类型作为该空间位置的细胞类型注释。利用本申请的方法、设备或介质进行空间细胞类型注释,大幅度减少了分析过程的计算量,提高了分析效率,增加了注释的准确性和稳定性。
技术关键词
注释方法 标志 矩阵分解算法 生物信息技术 数据 可读存储介质 转录组学 存储计算机程序 计算机设备 处理器 聚类 存储器
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