摘要
一种基于加权图网络与标签传播的宏基因组病毒分类方法,它涉及一种宏基因组病毒分类方法。本发明为了解决现有技术中ICTV分类标准的动态适应性不足、数据类别不平衡,且“暗物质”分类难的问题。本发明在数据库更新与构建过程,获取最新的病毒分类样本数据,构建最新的病毒蛋白质数据库;在加权图网络构建过程中首先将待测的病毒核苷酸序列翻译为蛋白质序列,然后通过马尔可夫聚类得到蛋白质聚类,最后通过边权重计算算法计算待测病毒序列与数据库中参考序列之间边的权重,构建加权图网络;在标签传播病毒分类过程,通过类别权重归一化标签传播算法,分三个阶段,对宏基因组病毒进行全面的病毒物种分类。本发明属于基因工程技术领域。
技术关键词
病毒
分类方法
网络
聚类
标签传播算法
构件数据库
数据库更新
基因工程技术
邻居
DNA序列
节点
核苷酸
软件
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阶段
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