摘要
结核分枝杆菌可分为具有遗传进化关系的谱系1至9(lineage1‑9,L1‑L9),谱系3(lineage 3,L3)又分为L3.1.1,L3.1.2,L3.2.1和L3.2.2。然而,仍有大量L3菌株不能被分型。本专利涉及一种用于鉴定结核分枝杆菌L3.1.1除L3.1.1.i1和L3.1.1.i2两个亚分支外的6个新的亚分支基因分型的SNP位点。具体而言,本专利提供一种对结核分枝杆菌L3.1.1除L3.1.1.i1和L3.1.1.i2两个既有亚分支外的6个新的亚分支深入分型鉴定的方法,以期为致病性基础研究和精准防控结核病提供理论支持。上述方法涉及包括37个SNP位点的集合,通过该SNP集合能够对结核分枝杆菌L3.1.1的6个新亚分支实现鉴定和遗传进化分析,从而实现对结核分枝杆菌谱系3传播更强的亚分支的鉴定和精准防控提供支持。
技术关键词
染色体
SNP位点组合
鉴定结核分枝杆菌
分支
试剂盒
质谱检测法
电离飞行时间质谱
变性梯度凝胶电泳
单链构象多态性
遗传进化分析
基质辅助激光
PCR检测法
单核苷酸多态性
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