一种小麦SNP育种芯片及其应用

本发明公开了一种小麦SNP育种芯片及其应用。本发明提供了用于检测小麦基因型的芯片，包括：特异性检测表1中5286个SNP位点的试剂和特异性检测表2中134个indel位点的试剂；表1中所述5286个SNP位点和表2中所述134个indel位点的位置信息均是基于小麦基因组参考序列进行比对确定的，所述小麦基因组参考序列为小麦品种中国春的全基因组序列，版本号为IWGSC RefSeq2.1。本发明与以往的小麦芯片相比，具有位点代表性高，多样性信息丰富、标记分布均匀的特点，芯片更加灵活，拥有更高的检出率和更好的重复性及更低应用成本。