摘要
本发明涉及公共卫生领域,为发热门诊呼吸道样本中未知病原体的智能识别与实时预警系统,包括:数据质控处理模块,对宏基因组原始测序数据进行质量控制与标准化预处理,得到纯净微生物读长;已知病原体识别注释模块,对已知病原体进行识别,对非宿主读长进行分类,根据分类结果构建分类数据库,并对分类结果中分类置信度低或未分类的读长进行注释得到注释表;识别模型训练模块,用于构建正负样本数据集,对识别模型进行训练;未知病原体识别模块,根据分类数据库及注释表,采用训练后的识别模型对纯净微生物读长的宏基因组中潜在的未知病原体进行识别。本发明可实现对已知及未知呼吸道病原体的识别、分类和动态监测。
技术关键词
实时预警系统
原始测序数据
识别模型训练
序列
识别模块
样本
呼吸道
病毒
预警模块
人类
接头
动态
层级
核酸
格式
蛋白
策略
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