基于变分图自编码器的空间组学数据补全方法及系统

本发明提出了基于变分图自编码器的空间组学数据补全方法及系统，涉及生物信息学技术领域。提取数据对中部分共有的基因，得到特征矩阵；基于空间位置信息，得到空间转录组学测序数据中细胞的第一子邻接矩阵；基于基因表达相似性，分别得到单细胞RNA测序数据中细胞的第二子邻接矩阵和数据对中细胞的第三子邻接矩阵；将第一子邻接矩阵、第二子邻接矩阵和第三子邻接矩阵合并，得到最终的邻接矩阵；将特征矩阵和最终的邻接矩阵输入至预训练的变分图自编码器网络中，完成对空间转录组学缺失基因的补全。本发明能够有效利用空转数据细胞间的位置信息和基因表达特征，不仅可以降低误差，同时还可以提高补全基因与真实值的相似性。