摘要
本发明公开了一种eDNA数据降维方法,在数据预处理与特征提取阶段,不仅对丰度数据进行标准化处理,还对序列数据进行翻译与编码,并通过自编码器对序列信息进行初步降维。构建图注意力自编码器,将丰度矩阵、降维后的序列矩阵以及基于K近邻策略构建的邻接矩阵同时输入到图注意力自编码器中,通过图注意力机制在潜在空间中更好地捕捉多源数据之间的隐含关联,对样本间的潜在关联进行探索与表征,从而获得更加稳健、清晰的低维表示。
技术关键词
数据降维方法
矩阵解码器
编码器
K近邻算法
重构
节点特征
核苷酸
代表
翻译规则
序列特征
样本
注意力机制
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